Bioinformatiker

Uppsala universitet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till ett av de 100 bästa universiteten i världen och en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 000 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.







Bioinformatiker med inriktning mot användning av array- och DNA-sekvensbaserade tekniker för genomanalys, vid Institutionen för medicinska vetenskaper, forskargruppen onkologisk endokrinologi med tillträde enligt överenskommelse. Anställningen är heltid för ett år med möjlighet till förlängning.

Institutionen för medicinska vetenskaper vid Uppsala universitet (www.medsci.uu.se) har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inom ett flertal områden. Onkologisk endokrinologi är ett profilområde både vid Uppsala universitet och vid Akademiska sjukhuset.

Tillgång till sekvensen från det humana genomet möjliggör globala genomanalyser med hjälp av ett flertal tekniker, såsom olika typer arrayer och storskalig parallell DNA-sekvensning. Ett av ansvarsområdena kommer att vara analyser av data genererade från Illumina och Nimblegen array-plattformarna i samband med analyser av genetisk och epigenetisk variation inom olika translationella forskningsprojekt. Nya snabba tekniker för att bestämma DNA-sekvensen, baserade på massiv parallell DNA-sekvensering, finns nu tillgängliga och gör det möjligt att bestämma en arts hela genom till en bråkdel av tidigare kostnader. Dessa tekniker finns etablerade vid Uppsala universitet. De genererar mycket stora datamängder och kräver en omfattande bioinformatisk analys.

Arbetsuppgifter: Som bioinformatiker vid Institutionen för medicinska vetenskaper, forskargruppen för onkologisk endokrinologi kommer du att ha ansvaret för informatikdelen inom ovan beskrivna verksamhet. Detta innebär att du tillsammans med forskarna planerar projektet, genomför de initiala dataanalyserna med hjälp av tillgängliga programvaror, samt tillgodoser datalagringsbehovet. Detta ställer krav på såväl bioinformatisk och biostatistisk som datateknisk kunskap. Stora möjligheter finns att utveckla egna analysmetoder eller testa nya metoder på de dataset som genereras.

Kvalifikationskrav: Högskoleutbildning med inriktning mot bioinformatik eller motsvarande. Dokumenterad erfarenhet inom området bioinformatik och biostatistik samt datateknisk erfarenhet; såsom tidigare erfarenhet av bioinformatisk genomanalys, dataprogrammering (JAVA, R, Perl, C++, shell-scripting) och arbete med olika operativsystem (Linux, Windows), utveckling av web-baserade plattformar för datainsamling och analys, erfarenhet av MySQL databaser.  Kompetens inom genomanalyser med hjälp av array-baserade metoder för studier av SNP-baserad variation, strukturell genetisk variation och variation inom CpG metylom, samt praktiskt erfarenhet med program för analyser av sekvenser från plattformar för massiv parallell DNA-sekvensering värderas högt.  En god förmåga att kommunicera med andra medlemmar i gruppen är mycket viktig samt förmåga att introducera yngre medarbetare till bioinformatiska analyser är väsentlig. Stor vikt kommer att fästas vid personlig lämplighet. Doktorsexamen inom genetik, bioinformatik eller biostatistik är meriterande men inte ett absolut krav.

Uppsala universitet har ambitionen att främja jämställdheten genom en jämnare könsfördelning. Flertalet anställda inom denna kategori är män varför vi gärna ser kvinnliga sökande till anställningen.

Lön sätts efter kompetens. Ange löneanspråk i ansökan.

Upplysningar om anställningen lämnas av professor Eva Tiensuu Janson, E-post: eva.tiensuu_janson@medsci.uu.se telefon 018-6114289. Ansökan bör innehålla meritförteckning (CV), eventuell publikationslista samt två referenser med kontaktinformation.

Välkommen med din ansökan senast 27 december 2013, UFV-PA 2013/3313. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Bioinformatiker


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.