Doktorand i biologisk superupplösande mikroskopiavbildning

KTH svarar för en tredjedel av Sveriges kapacitet av teknisk forskning och ingenjörsutbildning på högskolenivå. Utbildningen och forskningen täcker ett brett område – från naturvetenskap till alla grenar inom tekniken samt arkitektur, industriell ekonomi och samhällsplanering. Totalt finns vid KTH 13 400 studenter på grundnivå och avancerad nivå och nästan 1900 forskarstuderande. KTH har 4900 anställda.

Skolan för teknikvetenskap bedriver frontlinjeforskning inom ett brett fält, från forskning inom grundläggande ämnen som fysik och matematik, till teknisk mekanik med tillämpningar inom bland annat flygteknik och fordonsteknik. Skolan driver och utvecklar civilingenjörsutbildningarna teknisk fysik och farkostteknik, liksom utbildningsprogrammet Öppen ingång, kandidatprogrammet Simuleringsteknik och virtuell design och ett flertal masterprogram.

Vid avdelningen för tillämpad fysik har vi sedan 2008 utvecklat och applicerat superupplösande fluorescensmikroskopi för avbilding av den biologiska nanoskalan (upplösning < 50 nanometer).
Forskningen som bedrivs inom gruppen cellens fysik försöker via metodutveckling inom mikroskopi och modern biofysik kartlägga proteiners cellulära lokalisation och dynamik för att bättre kunna förstå grundläggande biologiska processer. Gemensamt med vår systergrupp för pediatrisk cell och molekylärbiologi vid Karolinska Institutet appliceras superupplösande mikroskopi även på relevanta kliniska frågeställningar. Speciellt studeras proteiner relaterade till viktiga processer som sker i hjärnan eller i njuren. Vår forskargrupp är placerad vid det nyligen etablerade biovetenskapscentrat Science for Life laboratory (SciLifeLab), där vi även ansvarar för en nationell facilitet för superupplösande avbildning, och det är vid detta centra denna anställning är placerad.


ARBETSUPPGIFTER
Hur proteinerna är lokaliserade och hur de interagerar styr deras möjlighet att reglera cellulära signaler. Proteinerna som man vill studera är dock väldigt små, typiskt kan man säga att de är ungefär 5 nm. Att avbilda så små saker har tidigare krävt att man använt elektronmikroskopi som tyvärr kräver att man mäter i döda celler. Under de senaste åren har man dock inom vanlig optisk-mikroskopi utvecklat superupplösningsmetoder som tillåter att man kan ta bilder inne i hela levande celler av proteiner märkta med fluorescenta molekyler på nanoskalan.

I detta forskningsprojekt kommer olika optiska superupplösningsmetoder (STED, SIM, PALM, dSTORM) att appliceras och utvecklas för att på nanoskalan avbilda var proteiner sitter och hur dem interagerar. För att riktigt lyckas med detta projekt behöver man utvecklas optimerad inmärkningen av proteiner så att nanoskalan inte störs (skiftar bilden). För att också bättre kunna förstå informationen i superbilderna behöva man kanske även utveckla nya verktyg för analysen och eventuella modeller för simuleringar av systemen. Är du den som kan göra detta möjligt och med nya ögon se vad inget tidigare sett och därmed ger oss möjligheten bättre förstå den biomolekylära nanoskalan? Ansök!

KVALIFIKATIONER
För behörighet krävs civilingenjörsexamen med inrikting mot biologisk fysik, bioteknologi, biomedicine eller annan motsvarande utbildning med relevans för området modern cellbiologisk avbildning. Utöver traditionella akademiska meriter så räknas ett för tjänsten relevant examensarbete, internationell erfarenhet och språkkunskaper som meriterande.
Den sökande ska ha ett stort intresse för forskning och utveckling. Tjänsten kräver god förmåga att arbeta självständigt och driva projektet framåt, att sätta sig in i nya frågeställningar, att samarbeta med andra personer i olika grupper.