Forskare

Arbetsbeskrivning

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens 100 främsta lärosäten. Här finns 41 000 studenter och 7 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Lunds Tekniska Högskola, LTH, är en teknisk fakultet inom Lunds universitet med forskning av hög internationell klass och stora satsningar på pedagogisk mångfald.



ARBETSUPPGIFTER

Avsikten är att inom ramen för ett pågående projekt fortsätta utveckla metoder och procedurer för analys av antikroppskodande gener framförallt såsom de kommer till uttryck i i antikroppsrepertoarer in vivo.

Inom ramen för tjänsten ska den anställde

- hantera sekvensdata såsom de erhålls från leverantörer av NGS-tjänster, huvudsakligen paired read MiSeq-baserad sekvensering,
- utveckla och använda system för initial filtrering och hantering av datafiler
- utveckla, kvalitetsgranska och använda nya och existerande mjukvaror för att definiera antikroppsrepertoarers sammansättning och uppbyggnad
- utveckla, kvalitetsgranska och använda nya och existerande mjukvaror för gruppering av sekvenser
- statistiskt analysera resultat av analyserna
 BEÖRIGHETSKRAV

 En lämplig kandidat för arbetsuppgiften

- är disputerad i immunteknologi samt har stor erfarenhet av hantering av stora datamängder
- har dokumenterad kunskap i datorarbete och skriptskrivning i Linuxmiljö och dokumenterad erfarenhet av programmering i Python, R och/eller andra programmeringsspråk
- har dokumenterad kunskap och erfarenhet av att arbeta mot datorcluster och liknande högprestanda beräkningsmiljöer
- har dokumenterad kunskap i etablering och användning av bioinformatiska verktyg för molekylär analys, inklusive för analys av antikroppsrepertoarer definierade genom transkriptomsekvensering av sekvenser tagna från benmärg
- har dokumenterad erfarenhet av analys av utfallet av anrikning/eliminering av sekvenser i samband med användning av kombinatoriska antikroppsbibliotek, speciellt sådana utvecklade för användning med fagdisplayteknologi
- har dokumenterad kunskap i värdering av bioinformatiska processer för molekylär analys av antikroppsrepertoarer
- har goda kunskaper i engelska i relation till vetenskaplig dokumentation och vetenskaplig kommunikation
- har dokumenterad erfarenhet av samverkan i forskningsprojekt






Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Vi ser jämställdhet och mångfald som en styrka och tillgång.
Välkommen med din ansökan!

Kontaktpersoner på detta företaget

Fredrik Levander
046-2223835
Sara Ek
+46462223824
Marianne Olsson
+46462224320
Mats Ohlin, professor
046-2224322
Ulrika Axelsson
+46462228615
Kristina Lundberg
+46462229638
Cornelia Lundblad
+46462224350
Carl Borrebaeck
+46462229613
Christer Wingren
08 7907055
Malin Lindstedt
+46462229256

Sammanfattning

Besöksadress

Box 118
None

Postadress

Box 118
Lund, 22100

Liknande jobb


Researcher

Researcher

26 april 2024

Biträdande forskare

Biträdande forskare

26 oktober 2023

20 september 2023

8 augusti 2023