Förste forskningsingenjör i bioinformatik

Arbetsbeskrivning

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 34 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välkommen med din ansökan!

Förste forskningsingenjör i bioinformatik med inriktning mot metabolit modellering

Diarienummer (dnr): AN 2.2.1.6-72-14

vid Computational Life Science Cluster (CLiC)

Kemiska institutionen (www.chemistry.umu.se/) bedriver forskning inom områdena biologisk kemi, miljö- och biogeokemi och teknisk kemi. Institutionen har ett starkt fokus på interdisciplinärt samarbete och god tillgång till modern analytisk instrumentering, inklusive de teknikplattformar som finns vid Kemiskt-biologiskt centrum i Umeå (www.kbc.umu.se/).

Computational Life Science Cluster (CliC, www.clicumu.se) utgör bioinformatik plattformen vid Umeå universitet med ca 35 forskare. Anställningen ingår i Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences (BILS, www.bils.se) som är en nationellt distribuerad forskningsinfrastruktur med stöd av Vetenskapsrådet. BILS tillhandahåller bioinformatisk infrastruktur och support på nationell nivå. Vidare kommer BILS att koordinera den svenska noden i den europeiska infrastrukturen för biologisk information ELIXIR.

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till ett år med möjlighet till förlängning. Tillträde enligt överenskommelse.

Huvudsakliga arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna innefattar att utveckla infrastruktur och metodik som krävs för storskalig metabolit-modellering och dataanalys. I detta arbete ingår att skapa web-baserade verktyg och databaser samt använda och utveckla nya beräkningsprogram för att utföra avancerad modellering av metabola nätverk. Därtill även att utarbeta nya metoder för statistisk dataintegration som baseras på multivariat dataanalys och kemometri i kombination med så kallad ?constrained optimization?- metodik. Du kommer att samarbeta med personal vid Swedish Metabolomics Center (SMC) i Umeå och forskarna vid Chalmers Systems biology group Du kommer även att samverka med övriga medarbetare inom BILS.

Kompetenskrav
Du har doktorsexamen inom naturvetenskapligt område med inriktning mot bioinformatik, eller motsvarande kompetens. Dokumenterad erfarenhet av programmering (C, Python, Perl, C, Java, Matlab, R, php, html5, javascript) krävs. Du har erfarenhet av databashantering (MySQL), flerkärniga beräkningar och systemadministration (Linux servrar). Dokumenterad erfarenhet av modellering av metaboliska nätverk samt hantering av olika biologiska data såsom metabolitdata och genuttrycksdata krävs. Du har goda muntliga och skriftliga färdigheter i engelska, är serviceinriktad, har god samarbetsförmåga och förmåga till självständigt arbete.

Övriga önskvärda kvalifikationer
Erfarenhet inom tvärvetenskapliga samarbeten är meriterande.

Närmare upplysningar lämnas av professor Johan Trygg, Computational Life Science Cluster (CLiC), Kemiska institutionen, Umeå universitet, 090-786 69 17, johan.trygg@chem.umu.se.

Facklig information lämnas av SACO, tel 090-786 53 65, SEKO, tel 090-786 52 96 samt ST, tel 090-786 54 31.

Till ansökan ska bifogas (1) en meritförteckning (CV), (2) kopior av examensbevis och publikationer, (3) namn och kontaktuppgifter till referenspersoner, samt (4) ett följe/ansökningsbrev med motivering.

Din ansökan skall vara inkommen till Umeå universitet senast 2014-02-14.

Sammanfattning

  • Arbetsplats: Umeå universitet UMEÅ
  • 1 plats
  • 6 månader eller längre
  • Heltid
  • Publicerat: 27 januari 2014

Liknande jobb


16 februari 2024

Bioinformatician

Bioinformatician

9 februari 2024

1-2 Data Stewards med fokus på humandatahantering

1-2 Data Stewards med fokus på humandatahantering

7 februari 2024

23 januari 2024