Förste forskningsingenjör/Biostatistiker

Institutionen för molekylärbiologi, som tillhör både den teknisk- naturvetenskapliga fakulteten och den medicinska fakulteten, har idag ca 200 medarbetare. Institutionens huvuduppgifter är forskning och forskarutbildning, grundutbildning och samverkan med det omgivande samhället. Institutionens forskning och utbildning innefattar flera molekylärbiologiska forskningsområden: Medicinsk och molekylär mikrobiologi och infektionsbiologi, Molekylär cellbiologi och forskning baserad på Genetiska modellorganismer. För mer information, se http://www.molbiol.umu.se

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 1 år. Tillträde enligt överenskommelse.

Beskrivning av projektet
Projektet har som målsättning att utveckla så kallad metabolomik eller globala metabola profileringstekniker samt att applicera detta på frågeställningar relaterade till läkemedelsresistens inom områdena tumörbiologi och infektionsbiologi. Specifikt så har vi hittills under projektet utvecklat en metod för kinetisk metabolomik med vilken vi odlar bakterier eller cancerceller i media innehållande stabil isotop. Med hjälp av LC-MS kan vi sedan följa isotopomerprofiler över tid. Denna information parat med parallella kvantitativa profiler ger mer information om den metabola systemdynamiken än vad kvantitativa profiler endast gör. Vi har hittills i projektet utvecklat, validerat och applicerat teknologin på ett antal olika modelsystem.

Huvudsakliga arbetsuppgifter
De huvudsakliga arbetsuppgifterna innefattar programmering, dataprocessning och statistiska analyser av LC-MS data insamlat i projektets biologiska applikationer. Att färdigställa påbörjad metodutveckling samt vidareutveckla databearbetningsmetoder för kinetisk metabolomik samt att konsolidera metoden och arbetsflödet till en applikation som kan användas av icke programmeringskunniga experter.

Kompetenskrav
Du har doktorsexamen inom biologi, cellbiologi eller molekylärbiologi eller motsvarande. Det krävs att du har mångårig erfarenhet av att programmera ?R? i framför allt biblioteken ?xcms? och ?limma?. Du är väl förtrogen med att arbeta med mass spektrometridata (rådata samt processad data) samt av isotopomeranalys. Vidare krävs det att du har mångårig erfarenhet av kemometrisk dataanalys. Du ska även ha erfarenhet av att analysera Next Generation Sequencing (NGS) data och tillhörande biologiska frågeställningar, tex analys av genomisk variation eller expressionsanalys. Du ska vara väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unix-miljö.

Övriga önskvärda kvalifikationer
Matlab programmering samt programmeringskunskaper i Perl/Python är meriterande.

Ansökan
Till ansökan ska bifogas 1) ett personligt brev med beskrivning av dina forskningsintressen och varför du är intresserad av befattningen, 2) meritförteckning, 3) namn på 1-2 referenspersoner samt 4) doktorsexamensbevis. Kopior av betyg och intyg ska vara styrkta.

Handlingar som skickas elektroniskt ska vara i Word- eller PDF-format.

Närmare upplysningar lämnas av Lektor Anders Nordström, 090-785 25 61, anders.nordstrom@molbiol.umu.se

Facklig information lämnas av SACO, tel. 090-786 53 65, SEKO, tel. 090-786 52 96 samt ST, tel. 090-786 54 31.

Din ansökan skall vara inkommen till Umeå universitet senast 2014-01-10.