Postdoktor i bakteriell genreglering

Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.



Institutionen för medicinsk kemi och biofysik bedriver forskning och undervisning vid Medicinska fakulteten.

Förutom institutionsgemensamma anslag för forskning och utbildning har institutionens forskargrupper ett stort antal nationella och internationella forskningsprojekt med extern finansiering. Vi är en internationell arbetsplats med medarbetare från många olika länder. 

 

Nu finns möjligheten att söka anställning som postdoktor inom bakteriell genreglering. Anställningen är på heltid med tillträde 1 juni 2024 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag 15 mars 2024. 

 

Projektbeskrivning

Hälften av jordens befolkning beräknas vara infekterad med den så kallade magsårsbakterien Helicobacter pylori. Infektionen är livslång om den inte behandlas. De allra flesta känner inte av infektionen och utvecklar heller inte sjukdom men hos vissa individer orsakar infektionen magsår eller magcancer. Miljön i magslemhinnan varierar och bakterien måste anpassa sig till den. Genom vår tidigare forskning med både in vivo och in vitro system har vi molekylärt beskrivit mekanismer som bidrar till att förstå hur H. pylori finjusterar sitt genuttryck. På sin yta har H. pylori vidhäftningsproteinet SabA som medierar bindning till sialyl-Lewis x/a antigener som finns i inflammerad magslemhinna. I detta projekt vill vi nu ytterligare fördjupa oss i de molekylära mekanismerna som bidrar till att H. pylori kan anpassa sig till den lokala miljön i magslemhinnan och hur uttrycket av SabA varierar i närvaro av olika faktorer. I projektet använder vi genetiska, molekylärbiologiska och biokemiska tillvägagångssätt för att analysera de bakomliggande mekanismerna för hur genuttrycket finjusteras. Ett betydande fokus kommer att ligga på DNA-proteininteraktioner. Resultaten från projektet kommer att bidra med kunskap om de molekylära mekanismer som styr genreglering i H. pylori och som också är relevanta och applicerbara i andra bakteriearter, särskilt hos bakterier med små genom och en begränsad uppsättning transkriptionsfaktorer.

 

Arbetsuppgifter 

Postdoktorn förväntas att aktivt delta i design och genomförande av experiment, dataanalys, utveckling och etablering av nya metoder i labbet, samt att presentera och publicera resultat. Kandidaten förväntas också delta i forskningsrelaterade aktiviteter inom forskargruppen såsom gruppmöten, journalklubbar, institutionsseminarier samt delta i nationella och/eller internationella möten.

 

Behörighet 

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom biokemi, molekylärbiologi eller mikrobiologi. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. 

 

Vi söker en motiverad kandidat som har dokumenterad laboratorieerfarenhet av molekylärbiologiska-, mikrobiologiska- och biokemiska metoder och praktiska erfarenheter av tillhörande generella tekniker inom DNA-, RNA- och proteinbiokemi liksom molekylär kloning. Du bör ha en relevant forskningsproduktion, vilket framgår av förstaförfattarskap, eller publikationer som presenterar goda forskningsrön inom områden som rör mekanismer som styr genuttryck eller interaktioner mellan värd och parasit.

Kandidaten måste behärska engelska i tal och skrift. Eftersom projektet kommer att vara av samverkanskaraktär förväntas kandidaterna fungera i ett team och därför ha en god samarbetsförmåga. God initiativförmåga och att arbeta självständigt är ett krav.

 

Meriterande 

Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag. 

 

Det är meriterande med laborativ erfarenhet av uttryck och rening av rekombinant proteiner, av metoder för studier av DNA-proteininteraktioner som EMSA, DNase footprinting, in vitro transkription samt biofysikaliska metoder som exempelvis SPR. Även erfarenhet av att konstruera knockout- och/eller site-specifika mutationer hos bakterier och odling av cellinjer  är meriterande liksom goda kunskaper i bioinformatik.

 

Mer om anställningen

Anställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid i 2 år enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor från 1 februari 2022. 

Mer information om gruppens forskning finns att läsa på vår websida https://www.umu.se/forskning/grupper/anna-arnqvist/

 

Information om institutionen för Medicinsk kemi och biofysik hittar du här

https://www.umu.se/institutionen-for-medicinsk-kemi-och-biofysik/

 

Institutionen för medicinsk kemi och biofysik är lokaliserad i Kemiskt Biologiskt Centrum

https://www.umu.se/en/chemical-biological-centre

 

Anna Arnqvist Björklunds team ingår i Umeå Centrum för mikrobiell forskning (UCMR)

https://www.umu.se/ucmr/om-ucmr

 

Ansökan

Ansökan ska innehålla:

·         En kort beskrivning av forskningsintressen och motivering till varför du är intresserad av anställningen.

·         CV

·         Publikationslista

·         Examensbevis från forskarutbildning samt andra relevanta examina

·         Kontaktinformation till två eller tre referenspersoner

·         Annan relevant dokumentation som du vill bifoga som stöd för din ansökan

Ansökan ska vara skriven på svenska eller engelska. Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast den 15 mars 2024

Vid frågor, kontakta prof Anna Arnqvist Björklund, anna.arnqvist@umu.se

Välkommen med din ansökan!