Postdoktor i datadriven infektionsbiologi

Arbetsbeskrivning

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda.  Universitetet erbjuder en mångfald av utbildningar av hög kvalitét. Vi bedriver utbildning och forskning med djup bredd och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden. Här gjordes till exempel den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. En av de viktigaste uppgifterna är att driva omställningen till ett mer hållbart samhälle. Läs mer om vårt hållbarhetsarbete https://www.umu.se/om-umea-universitet/klimat-och-hallbarhet/


Vårt geografiska läge i norr innebär unika möjligheter att bidra med ny och samhällsnyttig kunskap. Är du intresserad av att veta mer om Umeå universitet som arbetsplats läs mer https://www.umu.se/jobba-hos-oss/


Medicinska fakulteten är platsen för forskning och utbildning inom vetenskapsområdet medicin. Här finns 12 grundutbildningsprogram, 13 institutioner och ett 80-tal ämnesinriktningar inom forskarutbildningen.



Postdoktor i datadriven infektionsbiologi
Beskrivning
En fullt finansierad, tvåårig postdoktortjänst vid Institutionen för klinisk mikrobiologi, Umeå universitet.

Sista ansökningsdag 12 februari 2023

Datadriven upptäckt av nya mikrobiella sekundära metaboliter involverade i värd-mikrob och/eller mikrob-mikrob interaktioner.

Arbetsuppgifter
Mikrober producerar ett brett spektrum av sekundära metaboliter (SM), som gör att de kan interagera med sin miljö, såväl som med varandra. Det postdoktorala projektet som föreslås här kommer att involvera utveckling av (meta)genommetoder, som kan användas för att identifiera nya mikrobiella SMs involverade i mikrob-värd och/eller mikrob-mikrob interaktioner. De verktyg som utvecklas här kommer att tillämpas på stora mängder mikrobiell (meta)genomiska data, med målet att identifiera mikrobiella SM:er som är ansvariga för värd-sjukdomsfenotyper (t.ex. mikrobiomassocierade cancerformer) eller SM:er med nya antimikrobiella aktiviteter

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

- Ha en doktorsexamen, helst inom bioinformatik, beräkningsbiologi, datavetenskap, (bio)statistik eller ett närliggande område; kandidater från andra områden med starka programmerings-/kodningskunskaper (se nedan) uppmuntras också att ansöka.
- Vara skicklig i UNIX-skalskript, plus ett annat relevant språk (t.ex. Python, R).
- Behärska engelska i tal och skrift.
- Var bekväm med att arbeta i en mångsidig, inkluderande, tvärvetenskaplig och mycket samarbetsvillig miljö

Meriterande
Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.

Sökande bör ha tidigare erfarenhet av:
- Analysera genomiska data
- Utveckla mjukvara Dator i HPC-miljöer
- Med JavaScript eller relaterade språk (t.ex. Vega, Shiny)
- Biologiska eller kemiska vetenskapener

Mer om anställningen
Anställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid i 2 år enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor.

Du kommer att vara knuten till https://www.umu.se/institutionen-for-klinisk-mikrobiologi/

Tjänsten finansieras via SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS; https://www.umu.se/institutionen-for-klinisk-mikrobiologi/), en 12-årig satsning som syftar till att rekrytera och utbilda nästa generation av datadrivna livsforskare. Postdoktorn kommer att vara ansluten till det nationella DDLS-programmet, genom vilket de kommer att ha tillgång till datorresurser, den nationella DDLS-forskarskolan och andra utbildnings- och nätverksmöjligheter.

Postdoktorn kommer vidare att vara knuten till Laboratoriet för molekylär infektionsmedicin Sverige (MIMS; https://www.mims.umu.se/); MIMS är medlem i det nordiska EMBL Partnership for Molecular Medicine, som är dedikerat till det växande området för livsvetenskaper som undersöker den molekylära grunden för sjukdomar och utforskar molekylärt och genetiskt baserade behandlingar.

Ansökan
- En kort beskrivning av forskningsintressen och motivering till varför du är intresserad av anställningen.
- CV Publikationslista
- Examensbevis från forskarutbildning samt andra relevanta examina
- Kontaktinformation till två referenspersoner

Ansökan ska vara skriven på engelska. Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast den 12 februari 2023

 Välkommen med din ansökan!

 

 

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.


Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Kontaktpersoner på detta företaget

Forskare Vasili Hauryliuk, vasili.hauryliuk@umu.se
090-785 08 07
Marie-Louise Hammarström
+46-(0)90-785 1777
Tufve Nyholm
090-7858432
Mikael Karlsson
090-7852459
Andrei Chabes
090-786 59 37
Chatarina Carlen
090-786 65 09
Ewa Sundgren
090-785 61 44
Lina Holm
090-785 6111
Peter Andersen
+46 90 7852372
Anders Sjöstedt, Professor/Prefekt
090-785 11 20

Sammanfattning

Besöksadress

Umeå universitet
None

Postadress

Umeå universitet
Umeå, 90187

Liknande jobb


Forskare

Forskare

27 november 2023

Senior Scientist

Senior Scientist

27 april 2023

Projektassistent (2 månader) i virologi

26 april 2023

Amanuens vid institutionen för klinisk mikrobiologi

6 februari 2023