Tre doktorandplatser i beräkningskemi och beräkningsbiologi

Uppsala universitet

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till ett av de 100 bästa universiteten i världen och en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 500 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.

Tillträde den 1 april 2014 eller enligt överenskommelse.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi (ICM) är en av de mest internationella, breda och framstående biomolekylära institutionerna i Europa. Våra forskningsområden är indelade i sex program som täcker allt från cellbiologi till biofysik av enskilda molekyler. Tre doktorandplatser finns nu att söka i ämnesområdet beräknings och systembiologi med placering i Dr. Lynn Kamerlins och Prof. David van der Spoels forskargrupper.  Tillträde den 1:a april 2014, eller så snart som möjligt därefter.

Projektbeskrivning: Projekten innefattar modellering av enzymatiska reaktioner, förutsägelse av protein- och RNA-strukturer med hjälp av simuleringar, utveckling av nya metoder och mjukvaror inom forskningsområdet och även utveckling av nya fysiska modeller för att tillförlitligt kunna studera kemiska och biologiska system med hjälp av beräkningsmetoder.

Kamerlins forskargrupp inriktar sig på att förstå de faktorer som driver utvecklingen av enzymfunktion på molekylär nivå. Gruppen tillämpar de insikter sådan förståelse ger för att designa nya proteiner. Allt teoretiskt arbete utförs i nära samarbete med ledande experimentella grupper i Sverige och utomlands. Ett lånsiktigt mål är att utveckla och tillämpa relevanta beräkningstekniker för att framställa nya biologiska katalysatorer och bioterapier med mycket större (riktad) katalytisk förmåga än vad nuvarande generation av designer-enzymer har.

Noggrann modellering av organiska och biologiska molekyler kräver världsledande metoder och modeller. Van der Spoels forskningsgrupp har en lång tradition i utvecklingen av metoder som implementerats i det öppna programpaketet GROMACS. Projektet i denna forskargrupp består av att utföra en systematisk utveckling av nya kraftfält för molekylsimuleringar. Dessa nya kraftfält kommer att användas för storskaliga simuleringar av viruspartiklar för att studera inkorporeringen av nukleinsyror i en viruspartikel. Kunskapen kan sedan användas för att utveckla nya antivirala läkemedel.

Kvalifikationskrav: Ansökningar välkomnas från excellenta och motiverade kandidater med naturvetenskaplig examen på Masternivå. Tidigare erfarenhet av beräkningskemi eller beräkningsbiologi är ett krav. De sökande bör också ha goda förkunskaper inom biokemi, kemi eller (bio)fysik. Eftersom vår forskning är mycket interdisciplinär kommer kandidaterna att bedömas från fall till fall, och intresserade kandidater med bakgrund i bioinformatik eller datavetenskap kan också komma ifråga. Mycket god muntlig och skriftlig färdighet i det engelska språket är ett krav. Tidigare erfarenhet av programmering är meriterande.

För anställning som doktorand krävs att innehavaren är antagen eller kommer att antas till forskarutbildning, där graden av förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning är avgörande. Doktoranden ska främst ägna sig åt den egna forskarutbildningen. Övrig tjänstgöring vid institutionen, som avser undervisning och administrativt arbete, ingår inom ramen för doktorandplatsen (max 20 %). Information om utbildning på forskarnivå, behörighetskrav och antagningsbestämmelser finns på fakultetens hemsida, http://www.teknat.uu.se/forskning/utbildning-pa-forskarniva/. 


Under det första året får doktoranden ett utbildningsbidrag tillsammans med 20 % anställning som Assistent med utbildningsbidrag, från och med år två övergår dessa i en anställning som doktorand. Studietiden (på heltid) är maximalt fyra år. Bestämmelser för doktorander återfinns i Högskoleförordningen 5 kap §§ 1-7 samt i universitetets regler och riktlinjer http://regler.uu.se/Listsida/?kategoriId=139. Lokala riktlinjer finns fastställda för löneplacering.

Ansökan ska innehålla en meritförteckning (CV), en kort sammanfattning av kandidatens forskningsintressen och tidigare forskningserfarenhet, kopior av examensbevis och betyg, kopia av den sökandes Magisteravhandling (eller en sammanfattning) och ett följebrev som motiverar varför den sökande är intresserad av doktorandplatsen. Vi ser gärna att du bifogar två rekommendationsbrev eller kontaktuppgifter till två referenspersoner.

Upplysningar om anställningen lämnas av Dr. Lynn Kamerlin, tel. 018-471 4061, e-post: kamerlin@icm.uu.se, eller Prof. David van der Spoel, tel. 018-471 4205, e-post david.vanderspoel@icm.uu.se , för administrativa frågor personaladm. Lena Jansson 018-471 4416, e-post lena.jansson@icm.uu.se och övergripande institutionsfrågor prefekt Staffan Svärd, 018-471 4558, e-post staffan.svärd@icm.uu.se.

Se även forskargruppernas hemsidor: http://xray.bmc.uu.se/kamerlin och http://folding.bmc.uu.se.

Välkommen med din ansökan senast den 28 februari, 2014, UFV-PA 2013/3743. Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret

Tre doktorandplatser i beräkningskemi och beräkningsbiologi


Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Vi tar enbart emot ansökan på det sätt som beskrivs i annonsen.