Bioinformatiker

till Institutionen för biokemi och biofysik med placering på Science for Life Laboratory Stockholm

Ref.nr. SU FV-2944-13. Sista ansökningsdag: 2013-10-31

SciLifeLab (www.scilifelab.se) är ett nationellt centrum för storskalig livsvetenskaplig forskning med en avancerad teknologisk infrastruktur. Vid SciLifeLab utförs multidisciplinär forskning baserad på DNA sekvensering, genexpressionsanalys, proteomik, bioinformatik, biostatistik och systembiologi. Målsättningen är att göra det möjligt för svenska forskare att analysera gener, transkript och proteiner i olika organismer i avsikt att klarlägga molekylära mekanismer relaterade till hälsa och miljö. Exempel på tematiska forskningsområden som för närvarande bearbetas inom SciLifeLab är klinisk genomik/proteomik, cancergenomik och komplexa sjukdomars genomik samt ekologisk och miljörelaterad genomik. Bioinformatik och systembiologi är centrala aktiviteter inom centret, och en betydande del av personalen vid SciLifeLab arbetar inom dessa områden.

National Genomics Infrastructure (NGI) plattformen vid Science for Life Laboratory är en nationell resurs som erbjuder storskalig sekvensering och analys av sekvensdata åt externa beställare


Vi söker nu en till två bioinformatiker till vårt produktionsteam på NGI för att jobba med kvalitetskontroll, analys och leverans av sekvensdata, samt bidra till utveckling och förbättring av våra metoder och rutiner. Arbetsuppgifterna kommer bl a innefatta följande:

Kvalitetskontrollera och leverera sekvensdata som genererats inom NGI plattformen till externa beställare.

Analysera sekvensdata enligt best-practice protokoll samt tolka och bedöma analysresultat.

Medverka vid utveckling och implementation av protokoll för sekvensanalys.

Övervaka analyspipelines och dataflöden.

Besvara supportärenden och kommunicera med externa beställare.

Behörighetskrav

Högskoleexamen inom bioinformatik/molekylär bioteknik/teknisk biologi eller motsvarande kompetens.

Programmeringskunskaper inom t.ex. Python, Perl, Java, C/C++.

Väl förtrogen med att arbeta i Linux-/Unixmiljö.

Utmärkt kommunikations- och samarbetsförmåga.

Obehindrat tala och skriva engelska.

Meriterande

Tidigare erfarenhet av att analysera NGS data och tillhörande biologiska frågeställningar, t.ex. analys av genomisk variation eller expressionsanalys.

Erfarenhet av, eller intresse för molekylärbiologiska frågeställningar

Erfarenhet av databaser (SQL eller noSQL) och versionshanteringsverktyg, t.ex. git, SVN, cvs.

Tillträde snarast.

Administrativt kommer anställningarna att placeras vid Institutionen för biokemi och biofysik, Stockholms universitet.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

För detaljerad information om verksamheten på SciLifeLab Stockholm ber vi intresserade att studera den information som finns på http://www.scilifelab.se

Handlingar som skickas elektroniskt bör vara i Word eller PDF-format. OBS! Ange referensnumret SU FV-2944-13 i ärenderaden.