Doktorand i matematisk modellering av bakteriell metabolism

Arbetsbeskrivning

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, teknisk historia och filosofi.

Skolan för bioteknologi har som mål att ge en stark kunskapsbas för teoretiska och tillämpade frågeställningar inom livsvetenskaperna. Skolan består av sex avdelningar, genteknologi, glykovetenskap, industriell bioteknologi, proteinteknologi, proteomik och nanobioteknologi samt teoretisk kemi och biologi. Skolans verksamhet är lokaliserad till AlbaNova Universitetscentrum i Stockholm och Science for Life Laboratory i Solna. Vi är cirka 300 anställda, varav många är involverade i bioteknisk forskning på internationell toppnivå. Skolan erbjuder också civilingenjörs- och mastersutbildningar.



Arbetsuppgifter

Autotrofa bakterier kan använda sig av ett flertal olika energikällor för att metabolisera inorganiska kolkällor, som t.

ex. CO2 och CO. Dessa bakterier kan producera biobränslen eller bulkkemikalier i nästa-generationens bioreaktorer, eftersom de inte är beroende av sockerbaserade substrat. Syntesgasfermentation eller ”electrofuel biosyntheis” är exempel på detta. Med hjälp av beräkningsmodeller av bakteriell metabolism är det möjligt att identifiera potentiella autotrofer för dessa ändamål.

Detta projekt innefattar beräkningsanalys av autotrof metabolism och bioenergetik. Ansökande kommer att skapa metaboliska modeller för olika bakterier och arkeér, samt utveckla optimeringsalgoritmer för att förutsäga metaboliska hastigheter. Experimentell data kommer hämtas från litteratur eller produceras i laboratoriets egna bioreaktorer. De metaboliska modellerna kommer att användas för att ta fram lovande strategier för olika nästa-generationens bioproduktionssystem. Fokus kommer även läggas på att analysera och jämföra av de konstruerade metaboliska modellerna för att utforska bakteriell evolution. 

Kvalifikationer

Den sökande ska ha en kandidat- eller magisterexamen i biokemi, molekylärbiologi eller liknande ämnesområde. Du ska dessutom ha gedigen erfarenhet av programmeringsprogram, såsom Python eller MatLab. Kännedom av linjär programmering och optimering är en merit. Erfarenhet av statistisk analys av stora datasets är en merit. Erfarenhet av att skriva vetenskapliga manuskript är en merit. Den sökande skall vara starkt motiverad att utföra vetenskaplig forskning och skall ha väl utvecklat sinne för problemlösning och analytisk tänkande. 

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida. 

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Ansökan skall innefatta följande handlingar:

- Curriculum vitae
- Betygsavskrift från högskola/universitet
- Personligt brev

Övrigt

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.

Kontaktpersoner på detta företaget

Henrik Aspeborg, docent
e-post: henrik.aspeborg@biotech.kth.se
Joakim Lundeberg, professor
e-post: joakim.lundeberg@scilifelab.se
Ton Van Maris, professor
E-mail: tonvm@kth.se
Francisco Vilaplana, Universitetslektor
E-mail: franvila@kth.se
My Hedhamamr, Universitetslektor
e-post: myh@kth.se
Amelie Eriksson Karlström, Professor
E-post: amelie@biotech.kth.se
Adil Mardinoglu, Biträdande lektor
e-post: adilm@scilifelab.se
Paul Hudson, Biträdande lektor
070-783 9507, huds@kth.se
My Hedhammar, Universitetslektor
E-post: myh@kth.se
Aman Russom, Universitetslektor
E-post: aman@kth.se

Sammanfattning

Besöksadress

Roslagstullsbacken 21
None

Postadress

Roslagstullsbacken 21
Stockholm, 10691

Liknande jobb


Doktorander i industriell produktframtagning

Doktorander i industriell produktframtagning

12 april 2024

Doktorand i pedagogik

Doktorand i pedagogik

12 april 2024

Doktorand i Produktionssystem

Doktorand i Produktionssystem

10 april 2024

8 april 2024