Doktorand inom systembiologi

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, teknisk historia och filosofi.

Skolan för bioteknologi har som mål att ge en stark kunskapsbas för teoretiska och tillämpade frågeställningar inom livsvetenskaperna. Skolan består av sex avdelningar, genteknologi, glykovetenskap, industriell bioteknologi, proteinteknologi, proteomik och nanobioteknologi samt teoretisk kemi och biologi. Skolans verksamhet är lokaliserad till AlbaNova Universitetscentrum i Stockholm och Science for Life Laboratory i Solna. Vi är cirka 300 anställda, varav många är involverade i bioteknisk forskning på internationell toppnivå. Skolan erbjuder också civilingenjörs- och mastersutbildningar.



Arbetsuppgifter 

Systembiologi är ett tvärvetenskapligt ämne där systemen av biologiska komponenter studeras med hjälp av matematiska modeller, beräkningsmodeller och experimentella tekniker såsom genomik, proteomik, transkriptomik och metabolomik.

Det omfattar tillämpning och utveckling av systembiologiska metoder med särskilt fokus på integrering, analysering och modellering av stor mängd data inom området molekylär biovetenskap.

Nybildade Mardinoglu labb på SciLifeLab utvecklar fullgenomsmetaboliska modeller (GEMs) för mänskliga celler/vävnader. Dessa omfattande modeller tillämpas i analysen av omics-data som erhållits från patienter med komplicerade sjukdomar så som fetma, non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) , diabetes typ 2 (T2D) och vissa typer av cancer (t.ex. levercancer) Detta är ett spännande område inom biomedicinsk forskning som blir allt mer relevant i och med en ökning av vanliga metabola sjukdomar samt nya upptäckter av metabolisk omprogrammering i cancer.

Vi söker nu en doktorand med mycket goda beräkningsfärdigheter och förmåga att integrera GEMs med andra biologiska nätverk, inklusive reglerings-, signalerings- och protein-proteininteraktions (PPI) nätverk. Kandidaten kommer att använda dessa integrerade nätverk i analysen av omics data som erhållits från olika kliniska tillstånd. Syftet är att identifiera nya potentiella läkemedel och upptäcka biomarkörer för att utveckla effektiva behandlingsstrategier. Kandidaten kommer att arbeta i nära samarbete med experimentgrupperna samt ett antal stora läkemedelsbolag.

Kvalifikationer

Kandidaten förväntas bedriva forskning i systembiologi, systemmedicin, nätverksmedicin och bioinformatik. Vi söker därför en engagerad person med masterexamen i beräkningsbiologi/bioinformatik eller likvärdig master examen inom teknik relaterad till datavetenskap. I det senare fallet bör kandidaten även ha erfarenhet av bioinformatik, särskilt i ämnen relaterade till biologiska nätverk och liknande områden.

Den sökande bör har en relevant bakgrund inom tillämpad matematik och bioinformatik och då främst tidigare erfarenheter av nätverksmodeller/grafteori och analys av ”next-generation” sekvensdata. De sökande bör också vara skicklig på att programmera numeriska algoritmer i språk som MatLab, R och Python.

Den sökande bör vara mycket motiverad att utföra vetenskaplig forskning med anknytning till mänskliga sjukdomar. Vidare har den vi söker välutvecklad analytiska och problemlösande färdigheter samt har en förmåga att uttrycka sig väl, både i tal och i skrift.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida. 

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Ansökan skall innefatta följande handlingar:

- Curriculum vitae
- Betygsavskrift från högskola/universitet
- Kortfattad redogörelse varför den sökande vill ägna sig åt forskarstudier

Övrigt

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.