Forskarstuderande i bioinformatik till Science for Life Laboratory vid KTH

KTH är ett av Europas ledande tekniska universitet och en viktig arena för kunskapsutveckling. Som Sveriges största universitet för teknisk forskning och utbildning samlar vi studenter, forskare och fakultet från hela världen. Vår forskning och utbildning omfattar såväl naturvetenskap som alla grenar inom teknik samt arkitektur, industriell ekonomi, samhällsplanering, teknisk historia och filosofi.

Skolan för bioteknologi har som mål att ge en stark kunskapsbas för teoretiska och tillämpade frågeställningar inom livsvetenskaperna. Skolan består av sex avdelningar, genteknologi, glykovetenskap, industriell bioteknologi, proteinteknologi, proteomik och nanobioteknologi samt teoretisk kemi och biologi. Skolans verksamhet är lokaliserad till AlbaNova Universitetscentrum i Stockholm och Science for Life Laboratory i Solna. Vi är cirka 300 anställda, varav många är involverade i bioteknisk forskning på internationell toppnivå. Skolan erbjuder också civilingenjörs- och mastersutbildningar.



En forskarstuderandetjänst (licentiat, 2 år) är ledig på Science for Life Laboratory (SciLifeLab) i Stockholm, ett nationellt center för forskning inom livsvetenskaperna.

Vi söker en entusiastisk forskarstuderande till docent Olof Emanuelssons grupp, tillhörande skolan för bioteknologi på KTH.

Arbetsuppgifter

Arbetet kommer innehålla bioinformatisk metodutveckling för massivt parallell sekvensdata ("next-generation sequencing" data) med särskilt fokus på transkriptom-data (RNA-seq, allel-specifik expression, transkriptomrekonstruktion mm). Metodutveckling innebär bl a programmering, statistisk analys, maskininlärning (t ex neurala nätverk), och visualisering av resultat. Du kommer vidare att använda dina egna och andra metoder för att analysera transkriptom-data från våra samarbetsprojekt med grupper vid Karolinska Institutet (inflammationsprocesser i samband med hjärt- och kärlsjukdomar) och Sveriges Lantbruksuniversitet (kottsättning i gran, samt genklustring i Arabidopsis, en modellväxt). Alla projekt är samarbetsprojekt med experimentella grupper.

Observera att denna anställning som forskarstuderande är inom ramen för en licentiatstjänst. Det innebär att du anställs med sikte på en licentiatexamen, vilken normalt förväntas ta 2 år. Som forskarstuderande deltar du i forskningsarbete, går relevanta kurser på avancerad- och doktorandnivå, samt följer forskningsfältet genom bl a litteratur och seminarier. Du kommer också ha möjlighet att delta i undervisning på grund- och avancerad nivå, i första hand som datorövningsledare eller lektionsledare, eller med annan typ av institutionstjänstgöring. Tjänsten kan i så fall förlängas med upp till ett halvår.

Kvalifikationer

Lämplig bakgrund för denna tjänst är en masters- eller civilingenjörsexamen inom datavetenskap, matematik, fysik, bioinformatik, bioteknologi, eller närliggande fält. Erfarenhet av Unix (eller Unix-variant) och programmering är ett krav, t ex något eller några av följande språk: Python, Perl, R, C, eller Java. Kunskap om molekylärbiologi är meriterande. Förmåga att arbeta både självständigt och i samarbete värdesätts. Goda färdigheter i både skriven och talad engelska är ett krav. Stor vikt läggs vid personliga egenskaper.

Fackliga representanter

Du hittar kontaktuppgifter till fackliga representanter på KTH:s webbsida. 

Ansökan

Du ansöker via KTH:s rekryteringssystem. Du som sökande har huvudansvaret för att din ansökan är komplett när den skickas in.

Ansökan ska vara KTH tillhanda senast sista ansökningsdagen vid midnatt, CET/CEST (Central European Time/Central European Summer Time). 

Ansökan skall innehålla följande handlingar:

- Ett brev, i vilket du anger dina forskningsintressen och eventuella -erfarenheter
- Curriculum vitae
- Betygsavskrift från högskola/universitet
- Ett exempel på kommenterad källkod som du skrivit (även länk till repository går bra).

Övrigt

Vi undanber oss direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av platsannonser.