Postdoktor

Postdoktor i "Bioinformatics of Next Generation Sequencing data"
vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi/Beräknings- och systembiologi/Linnaeus Centrum för Bioinformatik med tillträde snarast eller efter överenskommelse.

Institutionen för Cell- och molekylärbiologi omfattar nio program med cirka 140 anställda.Programmet för Beräknings- och systembiologi samlar forskning och grundutbildning inom analys och modellering med hjälp av high-throghput data, modellering och simulering av biokemiska nätverks och biomolekylers dynamisk samt experimentell forskning på intracellulär kinetik.Här finns 21 anställda varav tolv doktorander.

Projektet: Postdoktorn kommer att arbeta med och utveckla avancerade maskininlärningsmodeller och metoder för analys av s.k. Next Generation Sequencing (NGS) data.Gruppen har tidigare framgångsrikt utvecklat Monte Carlo attributselektion och regelbaserad modellering byggd på rough-sets teori.Dessa metoder har använts i olika projekt senast i ett större projekt som syftar till att förstå enskilda och kombinerade histon-modifieringars roll i bl.a. alternativ splitsning av exon.
Arbetet sker i samarbete med ett flertal forskargrupper i Sverige och utlandet och sökanden förväntas vara öppen och ha lätt för att samarbeta i både mindre och större konstellationer.Sökanden förväntas delta i möten och diskussioner med samarbetspartners.Mer information om gruppen finns på http://www.lcb.uu.se/ .

Kvalifikationskrav: Doktorsexamen inom Bioinformatik, Beräkningsbiologi eller Datavetenskap med dokumenterad erfarenhet av projekt inom livsvetenskaperna.Sökanden måste ha avlagt doktorsexamen högst tre år före ansökningstidens utgång, undantaget om det föreligger speciella omständigheter.Stor vikt läggs vid forskningsbakgrund, publikationer och erfarenheter som är relevanta för projektet.


God erfarenhet om beräkningsaspekter av maskininlärning och statistik är önskvärt.Praktiska erfarenheter av NGS-data såsom lagring, analys och modellering är meriterande.Kunskap inom grundläggande molekylärbiologi är meriterande.Goda kunskaper i engelska är nödvändigt eftersom projektet sker i en internationell miljö.

Anställningsperiod: Anställningen omfattar två år med möjlighet till förlängning.Lön sätts efter kompetens.Det är önskvärt att löneanspråk anges i ansökan.



Ansökningsförfarande: Ansökan ska vara skriven på engelska och innehålla en kort beskrivning av sökanden inklusive forskningserfarenheter och meriter, intressen och relevanta färdigheter för positionen.Ansökan ska även innehålla följande bilagor: (1) CV med publikationslista, (2) en kort beskrivning (max en sida) av den tidigare forskningen samt (3) rekommendationsbrev eller referenser från tre tidigare arbetsgivare/samarbetspartners.Kopior av examensbevis får, men behöver inte, inkluderas.