Postdoktor i mikrobiell evolution

Uppsala universitet

Postdoktor i mikrobiell evolution med inriktning mot (meta)genomik och bioinformatik

Anställningen är tidsbegränsad till 2 år med början 1 november 2013.

Institutionen för cell- och molekylärbiologi är en internationell, bred och framstående biomolekylär institution i Europa. Institutionen omfattar sex skilda forskningsprogram med cirka 160 anställda.

En postdoktoral anställning som forskare i mikrobiell evolution med inriktning mot (meta)genomik och bioinformatik finns tillgänglig vid Uppsala Universitet i forskarassistent Thijs Ettemas forskargrupp inom SciLifeLab (www.scilifelab.se), Sveriges center för storskalig forskning inom biovetenskaperna. Tjänsten, som finansieras av ett ERC starting grant (Ettema), vilka tilldelas under mycket hård konkurrens, är begränsad till en tvåårsperiod. Efter ömsesidig överenskommelse kan en annan anställning komma att erbjudas efter denna tvåårsperiod. (http://www.icm.uu.se/forskning/molekylar-evolution/personal/thijs-ettema/).

Projektbeskrivning: Thijs Ettemas forskargrupp använder nydanande genomikteknologier för analys av enskilda celler som medel att analysera de mikroorganismer som inte låter sig odlas under laboratorieförhållanden, vilka tros utgöra 99 % av alla mikrober på vår planet. Genom att kombinera dessa odlings-oberoende tekniker med “next-generation” gensekvenseringsbaserade analysmetoder (jämförande genomik, fylogenetik) ämnar Ettemas forskargrupp att studera icke-odlingsbara mikroorganismer (“mikrobiell mörk materia”) på genomisk nivå. Sådana studier kommer att belysa den samlade diversiteten på vår planet. Dessutom kan dessa studier t o m ge ledtrådar till hur komplext liv kan ha uppkommit. Med finansiering från ett nyligen anhållet anslag (ERC Starting Grant) är målet med projektet att använda nya tekniker för att identifiera nya arkéer och bakterier, och att sekvensera deras genom med hjälp av metagenomiska och “single-cell”-genomiska tekniker. 

Kvalifikationskrav och i övrigt meriterande för anställningen: Behörig att anställas som postdoktor i detta fall är den som innehar en doktorsexamen inom bioinformatik, genomik eller relaterat forskningsfält. Vi söker en ”team player” med tidigare erfarenhet av att arbeta med ’next-generation’ sekvensdata och bioinformatiska metoder, samt vana av att arbeta i Linux/Unix–baserad datormiljö. Den sökande bör företrädelsevis ha erfarenhet av ”next-generation” sekvenseringsdata samt fylogenetiska tekniker. Mycket goda kunskaper i engelska, skriftligen såväl som muntligen, krävs. Erfarenhet av metagenomiska och “single-cell”-genomiska tekniker samt fylogenetiska verktyg ses som fördelar hos den sökande.

Ansökan: Sökande ska ha avslutat sina doktorsstudier senast tre år före ansökningstidens slut. Finns särskilda skäl kan även ansökningar från sökanden som tilldelats doktorstitel tidigare än tre år före ansökningstidens slut komma i fråga för tjänsten. Särskilda skäl innefattar tjänstledighet p.g.a. sjukdom, föräldraledighet, etc. Ansökan bör innehålla en kort beskrivning av forskningsintressen och relevanta erfarenheter (en sida), CV, kopior av examensbevis/motsvarande, samt kontaktuppgifter till tre namngivna referenspersoner.

Upplysningar om anställningen lämnas av Dr. Thijs Ettema, e-post: thijs.ettema@icm.uu.se, tel. 018-471 61 29.

Välkommen med din ansökan senast den 25 oktober, 2013, UFV-PA 2013/2730 Klicka på länken nedan för att komma till ansökningsformuläret.

Postdoktor i mikrobiell evolution med inriktning mot (meta)genomik och bioinformatik


Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Uppgiften är att bedriva forskning och utbildning av högsta kvalitet och att på olika sätt samverka med samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till ett av de 100 bästa universiteten i världen och en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har 40 000 studenter, 6 000 anställda och en omsättning på cirka 5,5 miljarder kronor.